Ve vědecké části projektu bylo na základě funkčního screeningu bakteriálních izolátů z aktivního kalu zatíženého FAL vybráno pět kandidátních kmenů s nejlepším degradačním potenciálem. Byla dokončena optimalizace analýzy FAL pomocí LC/MS a byl úspěšně modifikován luminiscenční test pro hodnocení cytotoxicity vodních vzorků. Byl dokončen vývoj biosenzorového čipu pro detekci nízkomolekulárních léčiv metodou MALDI-TOF. Povedlo se zavést zcela nový metodologický přístup pro přímou fenotypovou analýzu jednotlivých virových kandidátů přímo ve směsném vzorku. Podařilo se zprovoznit druhou linii laboratorního systému ČOV a byly doladěny technické parametry obou linií. Pokračovaly experimentální práce zaměřené na ověření degradačního potenciálu vybraných mikrobiálních kultur při biologickém rozkladu FAL při fermentaci s aktivní kulturou Tibi krystalů.

Došlo tedy k naplnění milníku 3.1 – Vývoj čipu pro jeden analyt, testování v kalech. Zároveň jsou finalizovány práce na úspěšném naplnění milníku 1.1. – Izolace, biochemická a taxonomická identifikace degradérů z environmentálních vzorků.

Byla připravena a zveřejněna odborná publikace s názvem: „Elucidation of new sulfamethoxazole catabolic pathways in whole-cell catalyst of bacterium Kocuria rhizophila SA117“ a dvě další publikace byly připraveny a odeslány do odborných časopisů.

V tomto monitorovacím období byla navázána spolupráce s biotechnologickou firmou DIANA Biotechnologies, a.s. Členky řešitelského týmu z firmy DEKONTA, a.s. se podílely na přípravě a podání mezinárodní grantové přihlášky pod akronymem LIFE4FARMS, která byla schválena k financování.

Dále byla úspěšně dokončena realizace dvou investic, kdy byly dodány analytické váhy a chlazená centrifuga. Rovněž proběhla příprava, vyhlášení a vyhodnocení největší veřejné zakázky a investice v projektu s názvem “Upgrade NMR spektrometru 600 MHz“. Na základě posouzení došlé nabídky byla 2. 10. 2025 uzavřena a následně i zveřejněna kupní smlouva s dodavatelem.

Realizace projektu probíhá v souladu s navrženým harmonogramem a jsou postupně plněny jednotlivé milníky projektu.

Soubor ke stažení:

Mikroorganismy v ekologické obnově – bakterie jako buněčné továrny pro řízené remediace ekosystémů (MICRO-BIOTECH) 

CZ.02.01.01/00/23_020/0008502

ZA 1. MONITOROVACÍ OBDOBÍ: 1. 1. – 30. 4. 2025

V počáteční fázi řešení projektu došlo ke konsolidaci projektového týmu, odborného i administrativního.  Byla nastavena spolupráce a komunikace, jak uvnitř týmů jednotlivých výzkumných aktivit a organizací v projektu, tak mezi týmy. Administrativní tým zajistil potřebné kroky k finanční řízení projektu a naplnil úvodní povinnosti publicity projektu (umístění plakátu a trvalé desky, zveřejnění na webu a na sociálních sítích). Data stewardka v kooperaci s vedoucími týmů vytvořila Data Managment Plán projektu.

Odborný tým zahájil činnost na všech výzkumných aktivitách projektu. Ve spolupráci s průmyslovými partnery byly vytipovány a získány vhodné vzorky aktivovaného kalu z míst, kde je vysoká koncentrace FAL v odpadních vodách a separovány vhodné bakteriální izoláty, které byly následně testovány. Pro testy byly použity i sbírkové kmeny, které jsou ve vlastnictví výzkumného týmu. Na základě výsledků testů budou vybrány kandidátní kmeny mikroorganismů s největším potenciálem. Pozornost byla rovněž věnována výzkumu potenciálu kompostováni pro biodegradaci. Současně jsou vyvíjeny a optimalizovány analytické metody pro sledování biodegradací. Rovněž byly připraveny série toxikologických testů pro sledování toxicity biodegradačních produktů FAL.

Bylo testováno nové depoziční zařízení pro nanášení protilátek na povrch biosensoru a následně optimalizovány depoziční postupy a rovněž byla zahájena optimalizace LC-MS/MS metody pro kontrolu fungování detekčního pole.

Výzkumné práce na problematice detekce specifických patogenních agens a patogenních determinant v čase se orientovaly na prvotní analýzy odpadních vod. Zaměřili jsme se jak na SARS-CoV-2, ale také na další virové patogeny, např. noroviry, enteroviry, virus hepatitidy A, rotaviry a bakteriální patogen Legionella, kde byly hledány vhodné cílové oblasti pro detekci a zahájena optimalizace amplifikačních metod.

Byl sestaven plně funkční model ČOV a zavedeny a ověřeny metody měření ukazatelů čistírenských procesů.

Soubor ke stažení: